Volume 6, Issue 1

Cardiovascular diseases keep being the leading cause of mortality in Spain. Efforts should be intensified to identify new risk factors that may contribute to increasing cardiovascular risk. Lipoprotein(a) (Lp(a)) has been associated with a higher risk for developing aortic valve stenosis, heart failure, ischemic stroke, ischemic heart disease and peripheral arterial disease. Hyperlipoproteinemia(a) is a common health problem. Between 10 and 30 % of the world population have Lp(a) values exceeding 50 mg/dL. The scientific evidence provided in the recent years confirms an independent association between Lp(a) and the risk for having an arteriosclerotic cardiovascular event. This finding, added to the emergence of new specific therapies for reducing Lp(a) has raised interest in the quantification of this lipoprotein. The objective of this paper was to perform a review of the evidence available to identify the patients who will benefit from undergoing Lp(a) testing and determine the recommended quantification methods, the desirable concentrations, and the role of Lp(a) determination in reclassifying the cardiovascular risk of patients.

Resumen Las enfermedades cardiovasculares continúan siendo la principal causa de muerte en España, lo que sugiere la necesidad de estudiar la presencia de nuevos factores de riesgo que puedan estar contribuyendo a aumentar el riesgo cardiovascular. La lipoproteína(a) (Lp(a)) se ha asociado con un mayor riesgo de desarrollar estenosis valvular aórtica, insuficiencia cardíaca, ictus isquémico, cardiopatía isquémica y enfermedad arterial periférica. La hiperlipoproteinemia(a) es un problema de salud generalizado. Entre el 10 % y el 30 % de la población mundial presenta valores de Lp(a) superiores a 50 mg/dL. La evidencia científica acumulada en los últimos años ha confirmado la existencia de una asociación independiente entre la concentración de Lp(a) y el riesgo de presentar un evento cardiovascular arteriosclerótico. Este hallazgo, unido al creciente desarrollo de nuevas terapias específicas para reducir la Lp(a), ha incrementado notablemente el interés por su medición. El objetivo de este documento es, en base a la evidencia actual, informar sobre a qué pacientes se debería medir la Lp(a), cuáles son los métodos de medición recomendados, las concentraciones deseables y la utilidad de su medición en la reclasificación de pacientes según su riesgo cardiovascular.

Objectives To evaluate seven bioinformatics platforms for automated AI-based genomic variant prioritization and classification. Methods An evaluation was performed of 24 genetic variants that explained the phenotype of 20 patients. FASTQ files were simultaneously uploaded on the following bioinformatics platforms: Emedgene, eVai, Varsome Clinical, CentoCloud, QIAGEN Clinical Insight (QCI) Interpret, SeqOne and Franklin. Automated variant prioritization and classification was performed using patient phenotypes. Phenotypes were entered onto the different platforms using HPO terms. The classification of reference was established based on the criteria of the American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG) and the Association of Molecular Pathology and ACMG/ClinGen guidelines. Results SeqOne demonstrated the highest performance in variant prioritization and ranked 19 of 24 variants in the Top 1; four in the Top 5, and one in the Top 15, followed by CentoCloud and Franklin. QCI Interpret did not prioritize six variants and failed to detect one. Emedgene did not prioritize one and failed to detect one. Finally, Varsome Clinical did not prioritize four variants. Franklin classified correctly 75 % of variants, followed by Varsome Clinical (67 %) and QCI Interpret (63 %). Conclusions SeqOne, CentoCloud, and Franklin had the highest performance in automated variant prioritization, as they prioritized all variants. In relation to automated classification, Franklin showed a higher concordance with the reference and a lower number of discordances with clinical implications. In conclusion, Franklin emerges as the platform with the best overall performance. Anyway, further studies are needed to confirm these results.

Resumen Objetivos Evaluar siete programas bioinformáticos de priorización y clasificación automática que utilizan algoritmos de inteligencia artificial. Métodos Se evaluaron 24 variantes genéticas que explicaran el fenotipo de 20 pacientes. Los archivos FASTQ se cargaron paralelamente en los siguientes programas bioinformáticos: Emedgene, eVai, Varsome Clinical, CentoCloud, y QIAGEN Clinical Insight (QCI) Interpret, SeqOne y Franklin. Para la priorización y clasificación automática, se utilizó el fenotipo de los pacientes, introduciéndolo en los programas mediante términos HPO. La clasificación de referencia se estableció siguiendo los criterios y recomendaciones de las guías clínicas de la American College of Medical Genetics (ACMG) and Genomics, Association of Molecular Pathology y ACMG/ClinGen. Resultados SeqOne tuvo el mejor rendimiento en priorización, colocando 19 de 24 variantes en el Top 1, cuatro en el Top 5 y una en el Top 15, seguido por CentoCloud y Franklin. QCI Interpret no priorizó seis variantes y no detectó una, Emedgene no priorizó una y no detectó otra, y Varsome Clinical no priorizó cuatro variantes. Franklin clasificó correctamente el 75 % de las variantes evaluadas, seguido por Varsome Clinical (67 %) y QCI Interpret (63 %). Conclusiones Respecto a la priorización automática, tanto SeqOne, CentoCloud, como Franklin realizaron una priorización automática de calidad, priorizando todas las variantes. En cuanto a la clasificación automática, Franklin mostró mayor concordancia con la referencia y menos discordancias con implicación clínica. Como conclusión final, Franklin parece ser actualmente el programa con mejor rendimiento global, pero se requieren más estudios para confirmar estos resultados.

Objectives To prospectively examine the ability of some glycemic variability metrics from continuous glucose monitoring (CGM) to predict the development of diabetes in a non-diabetic population. Methods A total of 497 non-diabetic patients from the AEGIS study were included. Participants used a CGM system (iPro2 ® ) over a six-day period. The following parameters were analyzed: standard deviation (SD), coefficient of variation (CV) and mean amplitude of glucose excursion (MAGE). Six-years follow-up was performed. ROC curves were constructed to determine the predictive value of glycemic variability metrics. Sensitivity and specificity were calculated. Results Of the 497 participants, 16 women (4.9 %) and 9 men (5.2 %) developed diabetes. Initial HbA 1c and fasting glucose levels were significantly higher in the participants who ultimately developed diabetes. Glycemic variability metrics were also significantly higher in these subjects (SD: 18 vs. 13 mg/dL; CV: 17 vs. 14 %; MAGE: 36 vs. 27 mg/dL; p<0.001 in all cases). SD showed the highest AUC (0.81), with a sensitivity of 80 % and a specificity of 72 % for a cut-off of 14.9 mg/dL. AUCs were higher in men for all metrics. Conclusions The metrics obtained by MCG, especially SD, are effective predictors of progression to type 2 diabetes in a non-diabetic population. These findings suggest that glycemic variability is useful for the early identification of subjects at a higher risk of developing diabetes.

Resumen Objetivos Evaluar prospectivamente la capacidad de distintas métricas de variabilidad glucémica obtenidas mediante monitorización continua de glucosa (MCG) para la predicción del desarrollo de diabetes en una población sin diabetes. Métodos Se incluyeron 497 participantes sin diabetes del estudio AEGIS. Los participantes utilizaron un sistema de MCG (iPro2 ® ) durante seis días. Se evaluaron las siguientes métricas: desviación estándar (SD), coeficiente de variación (CV) y amplitud media de las excursiones glucémicas (MAGE). Los sujetos fueron seguidos durante una media de 6 años. Se utilizaron curvas ROC para determinar la capacidad predictiva de las métricas de variabilidad glucémica y se calcularon la sensibilidad y especificidad. Resultados De los 497 participantes, 16 mujeres (4,9 %) y 9 hombres (5,2 %) desarrollaron diabetes. Las concentraciones iniciales de HbA 1c y glucosa en ayunas fueron significativamente más altos en aquellos que progresaron a diabetes. Las métricas de variabilidad glucémica también fueron significativamente mayores en estos individuos (SD: 18 vs. 13 mg/dL; CV: 17 % vs. 14 %; MAGE: 36 vs. 27 mg/dL; p<0,001 en todos los casos). La SD mostró la mayor AUC (0,81), con una sensibilidad del 80 % y una especificidad del 72 % para un punto de corte de 14,9 mg/dL. Las AUC fueron mayores en hombres para todas las métricas estudiadas. Conclusiones Las métricas obtenidas por MCG, especialmente la SD, son predictores efectivos de la progresión a diabetes tipo 2 en una población sin diabetes. Estos hallazgos sugieren la utilidad de la variabilidad glucémica en la identificación temprana de individuos en riesgo de desarrollar diabetes.

Objectives Reference intervals (RI) are an essential tool to support clinical decisions. These may have intra- and inter-individual variations associated with genetic differences and environmental factors. Given that Chile is a multiethnic territory, studying these variables is even more relevant. The purpose of this study was to establish RI for various hematological parameters in the Chilean population and the Mapuche ethnic group. Methods A sample of 356 adult individuals (aged 18–65 years), of which 146 belonged to the Mapuche ethnic group, was selected using the indirect a posteriori method from the database of the UC Temuco Clinical Laboratory. The analysis was conducted by sex and ethnicity. The Tukey fences method was employed to detect outliers, and the RIs were established through the non-parametric method recommended by the IFCC. Results The median age for the overall sample of the general population was 35 years (female) and 36 years (male). Differences (p<0.05) were found by sex in parameters dependent on hemoglobin and platelets counts. In the analysis by ethnicity, the parameters of RBC, HGB and HCT presented significant differences (p<0.0001). Conclusions This study shows that hematological RI vary according to sex and ethnicity, which must be considered in a multiethnic population. This understanding enhances our comprehension of the individual characteristics of each person and facilitates more accurate clinical interpretation.

Resumen Objetivos Los intervalos de referencia (IR) son una herramienta esencial para apoyar la toma de decisiones clínicas. Estos pueden presentar variaciones intra e interindividuales asociadas a diferencias genéticas y factores medioambientales. Dado que la población de Chile está compuesta por múltiples grupos étnicos, estas variables adquieren aún mayor relevancia. El objetivo del presente estudio es establecer IR para diferentes parámetros hematológicos en la población chilena y la etnia mapuche. Métodos Se seleccionó una muestra de 356 adultos (entre 18 y 65 años), de los cuales 146 pertenecían a la etnia mapuche, utilizando el método indirecto a posteriori a partir de la base de datos del laboratorio clínico UC Temuco. El análisis se realizó considerando el sexo y la etnia. Los valores atípicos se detectaron mediante la prueba de Tukey, mientras que los IR se establecieron aplicando el método no paramétrico recomendado por la IFCC. Resultados La mediana de edad de la muestra global de la población general fue de 35 años en mujeres y 36 años en hombres. Se observaron diferencias estadísticamente significativas (p<0,05) por sexo en los parámetros dependientes de la hemoglobina y del recuento de plaquetas. En el análisis por etnicidad, se observaron diferencias significativas en el recuento de glóbulos rojos, hemoglobina y hematocrito (p<0,0001). Conclusiones Este estudio demuestra que los intervalos de referencia hematológicos varían según el sexo y la etnicidad, lo cual debería ser considerado en una población multiétnica. Este hallazgo contribuye a un mejor conocimiento de las características individuales de cada persona, facilitando una interpretación clínica más precisa.

Objectives Obesity and overweight have increased in children and adolescents in Europe in the recent years, accounting for a major global public health problem. The objective of this study was the early detection of metabolic abnormalities in overweight/obese children (8–12 years old) that may ultimately induce impaired glucose metabolism and/or cardiovascular diseases. Methods Lipid metabolism and metabolic control parameters were measured and monitored in a group of 61 male and female children with overweight/obesity and a group of 45 healthy, normal weight children, comparing the results obtained. Ages ranged from 8 to 12 years. Results Higher levels of triglycerides and insulin and lower levels of high-density lipoprotein (HDL) cholesterol and apolipoprotein A1 were observed in overweight/obese children, as compared to normal weight children. Overweight/obese children exhibited higher apolipoprotein B/apolipoprotein A1 ratio, triglyceride-glucose ratio and HOMA index and a lower low-density lipoprotein (LDL) cholesterol/apolipoprotein B ratio. Conclusions Obesity at an early age (8–12 years) negatively affects lipid parameters. Hence, overweight/obese children presented a more atherogenic lipid profile, manifested as higher concentrations of remnant particles and small dense LDL particles, higher insulin resistance and a higher risk for developing diabetes mellitus type 2 and cardiovascular disease, as compared to normal weight children.

Resumen Objetivos La obesidad y el sobrepeso en la infancia y/o adolescencia han aumentado considerablemente en los países europeos, durante los últimos años, representando actualmente un importante problema de salud pública mundial. El objetivo de este estudio es la detección precoz en un grupo de niños con sobrepeso/obesidad (8–12 años) de las alteraciones metabólicas que pueden conducirles, incluso en edades tempranas, a alteraciones en el metabolismo de la glucosa y/o enfermedad cardiovascular. Métodos Se estudiaron una serie de parámetros del metabolismo lipídico y de control metabólico, en un grupo de 61 niños y niñas con sobrepeso/obesidad y en un grupo de 45 niños y niñas sanos, normopeso, de edades comprendidas, todos ellos, entre 8 y 12 años, comparando los resultados obtenidos. Resultados Se encontraron concentraciones más elevadas en el grupo de niños con sobrepeso/obesidad, respecto al de niños normopeso, en: triglicéridos e insulina; y más bajas en: colesterol HDL y apolipoproteína A1. El cociente apolipoproteína B/apolipoproteína A1, el índice triglicéridos-glucosa y el índice HOMA fueron más elevados y la ratio colesterol LDL/apolipoproteína B más baja en los niños con sobrepeso/obesidad. Conclusiones Según nuestros resultados, la obesidad a edades tempranas (8–12 años) afecta ya a la concentración de los parámetros lipídicos, habiéndose encontrado un perfil lipídico más aterogénico con mayor concentración de partículas remanentes y partículas LDL pequeñas y densas, mayor insulinoresistencia y mayor riesgo de desarrollar diabetes mellitus de tipo 2  y/o enfermedad cardiovascular en los niños con sobrepeso/obesidad, al compararlos con los normopeso.

Objectives Myelodysplastic syndromes (MDS) are clonal hematopoietic disorders characterized by peripheral blood cytopenias, cellular dysplasia and risk for progression into acute leukemia. Recent studies reveal that some research parameters available on Sysmex XN-1000 ® hematology analyzers, including immature platelet fraction (IPF), Neutrophil Granularity Index (Neu-GI), or platelet distribution width (PDW), show a relationship with dysplasia in peripheral blood. The objective of this study was to examine the association between classic and research blood count parameters and the presence of dysplasia. The secondary objective was to develop a multivariate model that allows the prediction of dysplasia with high probability. Methods Seventy-five patients older than 60 years with anemia, leukopenia or thrombocytopenia, without vitamin B12 and folate deficiency or hematological diseases underwent testing with the Sysmex XN-1000 analyzer. Results Dysplasia was confirmed in 32 % of patients, with significant differences in Neu-GI, PDW and IPF count between the groups of patients with and without dysplasia. Neu-GI was the parameter with the highest predictive value (AUC=0.98), with such value not increasing significantly after the addition of PDW or PIF. A Neu-GI value≤146ch predicts dysplasia with a positive predictive value=90 %. Conclusions Neu-GI is the parameter most strongly associated with dysplasia. A Neu-GI value≤146ch indicates a high probability of dysplasia and supports indication for a blood smear review. Additionally, values>152ch indicate a low probability of dysplasia.

Resumen Objectivos Los síndromes mielodisplásicos (SMD) son trastornos clonales hematopoyéticos caracterizados por citopenias en sangre periférica, displasia celular y riesgo de progresión a leucemia aguda. Estudios recientes reportan que algunos parámetros de investigación de los analizadores Sysmex XN-1000 ® , tales como fracción de plaquetas inmaduras (IPF), Índice de granulación de neutròfilos (Neu-GI), o ancho de distribución plaquetar (PDW), muestran relación con el hallazgo de displasia en sangre periférica. El objetivo es evaluar el grado de asociación de parámetros hematimétricos clásicos y de investigación con la presencia de displasia, y obtener un modelo multivariante que permita su predicción con elevada probabilidad. Métodos Se estudiaron 75 pacientes mayores de 60 años con anemia, leucopenia o trombopenia, sin déficit de factores madurativos ni enfermedades hematológicas, utilizando el analizador XN-1000 (Sysmex). Resultados Se observó displasia en el 32 % de los pacientes. Neu-GI, PDW e IPF muestran diferencias significativas entre pacientes con y sin displasia. Neu-GI reporta la mayor capacidad predictiva (AUC=0,98), sin que la adición de PDW o IPF la incremente de forma significativa. Un valor de Neu-GI≤146ch predice displasia con VPP=90 %. Conclusiones Neu-GI es el parámetro más asociado con displasia. Un valor Neu-GI ≤146ch indica alta probabilidad de displasia y justifica la revisión del frotis sanguíneo, mientras que valores >152ch sugieren baja probabilidad de displasia.

Objectives Centrifugation is a key process that should be controlled to ensure an adequate sample quality. To achieve rapid, standardized, and consistent sample centrifugation, we aimed to evaluate an alternative centrifugation protocol and its impact on the results of 20 biochemical determinations in serum. Methods The study included 45 ambulatory patients. Two serum-separating tubes were collected from each patient (Becton Dickinson (BD) Vacutainer ® SST™ II Advance, 8.5 mL Ref. 366468) . One of the tubes was centrifuged at 2,530 ×   g for 10 min (control method), while the other tube was centrifuged under alternative centrifugation conditions, namely 2,530 ×   g for 7 min. Results The analysis of results revealed that calcium, total bilirubin, and magnesium exhibited a constant and proportional systematic bias. However, considering the proportional mean difference, all analytes met the desirable bias performance established by our laboratory, except for magnesium, which met the minimum bias criteria. Conclusions Our study demonstrates that both centrifugation protocols are interchangeable for measuring the studied analytes, thereby ensuring adequate sample quality.

Resumen Objetivos La centrifugación es un proceso clave que debemos controlar para asegurar una adecuada calidad de la muestra. Con el objetivo de conseguir una centrifugación de muestras unificada y estandarizada en el menor tiempo posible, nos propusimos evaluar un protocolo de centrifugación alternativo y su influencia en los resultados de 20 determinaciones bioquímicas en suero. Métodos Fueron incluidos en el estudio 45 pacientes ambulatorios. A cada paciente se le extrajeron 2 tubos de suero con gel separador ( Becton Dickinson (BD) Vacutainer ® SST™ II Advance, 8,5 mL Ref. 366468 ) . Uno de ellos fue centrifugado a 2530× g durante 10 minutos, método control. El otro tubo de suero fue centrifugado en unas condiciones de centrifugación alternativas, a 2530× g durante 7 min. Resultados El análisis de los resultados muestra que el calcio, la bilirrubina total y el magnesio presentan un error sistemático constante y proporcional. Sin embargo, atendiendo a la diferencia de medias proporcional, todas las magnitudes cumplen el requisito del error sistemático deseable aceptado por nuestro laboratorio, a excepción del magnesio, que cumple el error sistemático mínimo. Conclusiones Nuestro estudio demuestra que ambas condiciones de centrifugación son intercambiables para la medición de las magnitudes estudiadas, asegurando una adecuada calidad de la muestra.

Objectives Chanarin-Dorfman syndrome is a rare disease inherited in an autosomal recessive pattern whose prevalence does not exceed 130 cases worldwide. Case presentation A 4-year-old patient with generalized erythematous-desquamative ichthyosiform syndrome since birth. The main laboratory finding was persistent hypertransaminasemia. Supplementary studies included peripheral blood smear (PBS), which revealed the presence of multiple cytoplasmatic vacuoles in polymorphonuclear leukocytes (PMN) and platelets. Ichthyosiform lesions concomitant to the presence of lipid vacuoles in peripheral blood PMNs are signs of Chanarin-Dorfman syndrome. Diagnostic suspicion was confirmed by genetic sequencing. Conclusions Chanarin-Dorfman syndrome is characterized by a mutation in the CGI-58 gene. This gene is involved in the catabolism of long-chain triglycerides stored in cytoplasmic lipid droplets. Jordans’ anomaly is a congenital alteration characterized by the presence of multiple vacuoles in the granulocytic series due to defective lipid metabolism. In this syndrome, long-chain triglycerides build up in tissues, thereby causing dermatological manifestations that are controllable through diet.

Resumen Objetivos El síndrome de Chanarin-Dorfman es un síndrome raro de herencia autosómica recesiva cuya prevalencia no supera los 130 casos en el mundo. Caso clínico Paciente de 4 años afecto de síndrome ictiosiforme eritemato-descamativo generalizado desde los primeros días del nacimiento. En el informe de laboratorio destacó hipertransaminemia persistente en el tiempo. Entre otras pruebas complementarias, se realizó el frotis de sangre periférica (SP), revelando la presencia de múltiples vacuolas citoplasmáticas en el interior de los leucocitos polimorfonucleares (PMN) y plaquetas. Las lesiones ictiosiformes junto con la presencia de vacuolas lipídicas en los PMN de SP son signos compatibles con síndrome de Chanarin-Dorfman. El diagnóstico se confirmó mediante secuenciación genética. Conclusiones El síndrome de Chanarin-Dorfman está caracterizado por una mutación del gen CGI-58 , el cual está implicado en el catabolismo de los triglicéridos de cadena larga almacenados en gotas lipídicas citoplasmáticas. La anomalía de Jordans es un rasgo congénito caracterizado por la presencia de abundantes vacuolas en la serie granulocítica debido a defectos en el metabolismo lipídico. En este síndrome, los triglicéridos de cadena larga se depositan en los tejidos produciendo principalmente manifestaciones dermatológicas controlables mediante la restricción de los mismos en la dieta.