Volume 1, Issue 4

Background The pandemic caused by the emergence of the new SARS-CoV-2 virus worldwide has had a major impact at all levels and has forced in-depth research into its behavior, pathogenicity and treatment. Content This review provides an overview of various aspects of the virus and the immune response it triggers, as well as a description of the different diagnostic and therapeutic approaches adopted. Summary SARS-COV-2 is a RNA virus with some peculiarities that make it different from its predecessors SARS-CoV and MERS. Given its structural characteristics and pathogenesis, it can cause different clinical manifestations as the disease progresses. The immune system has been proven to play a major role in the response to this virus and, therefore, the study of antibodies and lymphocyte populations during the different stages of the disease is crucial. Outlook The knowledge of the effect of the virus and the immune response is crucial for the development of good quality vaccines, therapies and diagnostic techniques, which are essential for the control and eradication of the disease.

Resumen Objetivos Aportar una breve revisión del conocimiento actual sobre el virus SARS-CoV-2, cuya irrupción ha causado un gran impacto en la sociedad a escala mundial. Contenido Esta revisión aporta una visión general de diversos aspectos del virus y de la respuesta inmunitaria que desencadena, así como aproximaciones diagnósticas y terapéuticas que se están llevando a cabo. Resumen SARS-CoV-2 es un virus RNA con características peculiares que lo diferencian de sus predecesores SARS-CoV y MERS. Dada sus características estructurales y su patogenia, es capaz de provocar diversas manifestaciones clínicas según avanza la enfermedad. Se ha demostrado que el sistema inmunitario juega un papel importante en la respuesta frente a este virus y, por ende, es crucial el estudio de los anticuerpos y las poblaciones linfocitarias durante los distintos estadios de la enfermedad. Perspectiva El conocimiento del efecto del virus y la respuesta inmunitaria es determinante para el desarrollo de vacunas, terapias y técnicas diagnósticas de calidad, esenciales para el control y la erradicación de la enfermedad.

In vitro allergen-specific immunoglobulin E (IgE) detection and quantification tests are routinely performed in clinical laboratories to diagnose patients with a suspected allergy. Numerous commercial assays are available to test for allergies, but the results can vary widely, thereby influencing both diagnosis and treatment. Given the challenges posed by differences in the various assays for in vitro determination of specific IgE, a group of experts has compiled in a document a series of recommendations on the implications that the use of a certain in vitro technique may have and the impact on the management of the allergic patient that the differences between the various techniques represent. The reading and analysis of this consensus document will help to understand the implications of the change of in vitro diagnostic method in the management of the patient with allergy, in the quality of life and in the socioeconomic costs associated with the disease.

Resumen En la evaluación del paciente con sospecha de alergia las pruebas de detección y cuantificación de la inmunoglobulina E (IgE) específica in vitro se usan de manera habitual en los laboratorios clínicos para ayudar en el diagnóstico de la alergia. Actualmente existen diferentes alternativas comerciales para realizar estos ensayos, pero los resultados obtenidos por cada uno de ellos pueden variar, lo que condiciona el diagnóstico y el tratamiento que se le proporcionará al paciente. Con el fin de dar respuesta a los retos planteados por las diferencias entre las distintas técnicas para la determinación in vitro de la IgE específica, un grupo de expertos ha recogido en un documento una serie de recomendaciones sobre las implicaciones que puede tener el uso de una determinada técnica in vitro y el impacto en el manejo del paciente alérgico que suponen las diferencias entre las distintas técnicas. La lectura y el análisis de este documento de consenso ayudarán a entender las implicaciones que tiene el cambio de método de diagnóstico in vitro en el manejo del paciente con alergia, en su calidad de vida y en los costes socioeconómicos asociados a la enfermedad.

Objectives The postoperative period of cardiac surgery (CS) is associated with the development of major adverse cardiovascular events (MACEs). However, the evaluation of MACE after CS by means of biomarkers is poorly developed. We aimed to evaluate postoperative biomarkers that could be associated with MACE. Methods Two Hundred and ten patients who underwent CS were enrolled during the study period. The diagnosis of MACE was defined as the presence of at least one of the following complications: acute myocardial infarction, heart failure, stroke presented during intensive care unit (ICU) stay, and 30-day mortality after CS. High-sensitive troponin T (hs-TnT), C-reactive protein, procalcitonin, interleukin-6, and immature platelet fraction (IPF) were measured on ICU admission and after 24 h. The difference between both measurements (Δ) was calculated to assess their association with MACE. Early infected patients (n=13) after CS were excluded from final analysis. Results The most frequent surgery was single-valve surgery (n=83; 38%), followed by coronary artery bypass graft (n=72; 34%). Postoperative MACE was diagnosed in 31 (14.8%) patients. Biomarker dynamics showed elevated values at 24 h compared with those at ICU admission in patients with MACE versus no-MACE. Multivariate analysis showed that ΔIPF (OR: 1.47; 95% CI: 1.110–1.960; p=0.008) and Δhs-TnT (OR: 1.001; 95% CI: 1.0002–1.001; p=0.008) were independently associated with MACE. Conclusions These findings suggest that postoperative ΔIPF and Δhs-TnT may be useful biomarkers for the identification of patients at risk of MACE development.

Resumen Objetivos Aunque los eventos cardiovasculares adversos mayores (MACE) son frecuentes en el postoperatorio de la cirugía cardíaca (CC), no se suele evaluar el riesgo de desarrollarlos. Analizamos una serie de biomarcadores postoperatorios potencialmente relacionados con el desarrollo de MACE durante el postoperatorio de CC. Métodos Se incluyeron 210 pacientes de CC. Se consideraron MACE el infarto agudo de miocardio, fallo cardíaco, ictus durante el ingreso en la unidad de cuidados intensivos, y mortalidad a los 30 días tras la CC. Se midieron la troponina T de alta sensibilidad (hs-TnT), proteína C reactiva (PCR), procalcitonina (PCT), interleucina 6 (IL-6) en plasma y la fracción de plaquetas inmaduras (IPF) en sangre al ingreso en la UCI y a las 24 h. Se calculó la diferencia entre ambas medidas (Δ) para evaluar la relación entre estos biomarcadores y MACE. Los pacientes con infección inmediata tras la CC (n=13) fueron excluidos del análisis final. Resultados Las intervenciones más frecuentes fueron la cirugía univalvular (n=83; 38%) y la cirugía de revascularización coronaria (n=72; 34%). Se diagnosticaron MACE postoperatorios en 31 (14.8%) pacientes. Los pacientes con MACE mostraron una elevación de biomarcadores a las 24 h con respecto al ingreso en la UCI. Se observó una relación independiente entre ΔIPF (OR: 1.47; 95% CI: 1.110–1.960; p=0.008) y Δhs-TnT (OR: 1.001; 95% CI: 1.0002–1.001; p=0.008) y los MACE. Conclusiones Las concentraciones postoperatorias de ΔIPF y Δhs-TnT pueden ser útiles para identificar a pacientes con riesgo de desarrollar MACE.

Objectives Chosen cutoff for cytokeratin 19 fragment antigen (CYFRA 21-1) as a tumor biomarker considerably influences its diagnostic and prognostic usefulness. The aim of the present study is to determine an optimal cutoff value for diagnostic validity of CYFRA 21-1 by Lumipulse ® technology in patients with suspected cancer and also to determine if CYFRA 21-1 levels provide prognostic value. Methods A consecutive 284 patients suggestive of malignant disease from six hospitals of Madrid were enrolled in a retrospective design. Optimal CYFRA 21-1 cutoff value was obtained by receiver operating characteristic curve and Youden test. The diagnostic validity was evaluated according to sensitivity, specificity, predictive values and likelihood ratios. The prognostic value of CYFRA 21-1 was checked using multiple logistic regression. Thirty-two diagnostic cancers were confirmed. Results The most optimal cutoff was 3.15 ng/mL. This cutoff showed a better specificity 93.63% (95% confidence interval [CI], 89.66–96.16), positive predictive value 60.98% (95% CI, 44.54–75.38) and positive likelihood ratio 12.65 (95% CI, 7.64–20.95) than the cutoff recommended by Fujirebio ® (1.8 ng/mL) (specificity: 73.71% [95% CI, 67.72–78.95], positive predictive value: 29.79% [95% CI, 21.02–40.23] and positive likelihood ratio 3.43 [95% CI, 2.71–4.35]), improving the current diagnostic accuracy. In multivariate analysis, elevated levels of CYFRA 21-1 (>3.15 ng/mL) was confirmed as an unfavorable prognostic factor. Conclusions The best cutoff for CYFRA 21-1 obtained was 3.15 ng/mL in patients with suspected cancer. This new cutoff decreases the false positive rate and improves the diagnostic efficacy of CYFRA 21-1 as a tumor marker as well as its association with death events.

Resumen Objetivos El punto de corte utilizado del CYFRA 21-1 como marcador tumoral influye considerablemente en su utilidad diagnóstica y pronóstica. El objetivo de este estudio es establecer un punto de corte óptimo de CYFRA 21-1 que tenga validez diagnóstica, determinado con la tecnología Lumipulse ® en pacientes con sospecha de cáncer. El objetivo secundario de este estudio es determinar si los niveles de CYFRA 21-1 tienen valor pronóstico. Métodos Se llevó a cabo un estudio retrospectivo en una muestra compuesta por 284 pacientes con sospecha de enfermedad maligna procedentes de seis hospitales de Madrid. El punto de corte se obtuvo mediante la curva ROC y el test de Youden. La validez diagnóstica se evaluó de acuerdo con la sensibilidad, especificidad, valores predictivos y ratios de probabilidad. El valor pronóstico de CYFRA 21-1 se determinó por medio de la regresión logística múltiple. Se confirmaron un total de 32 casos de cáncer. Resultados El punto de corte más óptimo fue 3,15 ng/mL. Este punto de corte mostró mejor especifidad, de 93,63% (89,66–96,16; IC 95%), Valor Predictivo Positivo (44,54–75,38; IC 95%) y Razón de Probabilidad Positiva 12,65 (7,64–20,95; IC 95%) que el punto de corte recomendado por Fujirebio ® (1,8 ng/mL); con una especifidad de 73,71% (67,72–78,95; IC 95%), Valor Predictivo Positivo: 29,79% (21,02–40,23; IC 95%) y una Razón de Probabilidad Positiva de 3,43 (2,71–4,35; IC 95%), mejorando la precisión diagnóstica actual. En el análisis multivariante, se confirmó que los niveles elevados de CYFRA 21-1 (>3,15 ng/mL) son un factor pronóstico desfavorable. Conclusiones El mejor punto de corte obtenido para CYFRA 21-1 fue de 3,15 ng/mL en pacientes con sospecha de cáncer. Este nuevo punto de corte reduce la tasa de falsos positivos y mejora la eficacia diagnóstica de CYFRA 21-1 como marcador tumoral, así como su asociación con la mortalidad.

Objectives Lactose malabsorption is generally assessed by hydrogen breath testing (HBT). However, this test is not recommended in patients with high baseline hydrogen concentrations (H 2 B). In addition, breath testing is not recommended in the current situation created by the COVID-19 pandemic, due to the potential infectiveness of the samples. The objective is to assess concordance between HBT and lactose tolerance test (LTT) depending on H 2 B concentrations. Methods A total of 430 patients (40 years, Q1–Q3 = 28–54 years; 66.7% women) suspected of lactose malabsorption were included in the study. Breath and heparinized blood samples were collected at baseline and sequentially after the intake of 50 g of lactose, to measure hydrogen in breath and glycemia in blood, respectively. Results H 2 B was <10 ppm in 69.5% of subjects; 10–20 ppm in 14.7%; and >20 ppm in 15.8% of subjects. In patients with H 2 B <20 ppm, concordance between HBT and LTT was moderate and consistently improved when the cut-off in LTT was set at 15 mg/dL. The increase in hydrogen and glucose correlated negatively (r=−0.389; p<0.05). The increase in glycemia during LTT was not influenced by H 2 B levels obtained in HBT. Conclusions LTT emerges as an alternative to HBT to assess lactose malabsorption in the presence of high H 2 B levels or when breath testing is not recommended by the circumstances. The best concordance was obtained when the cut-off for LTT was set at 15 mg/dL.

Resumen Objetivos La malabsorción de lactosa se estudia habitualmente mediante el test de hidrógeno espirado (HBT), aunque su realización no es recomendable cuando la concentración de hidrógeno basal (H 2 B) es elevada. Además, la situación actual en relación con el SARS-CoV-2 puede hacer desaconsejable el manejo de muestras de aliento. Objetivo: Evaluar la concordancia del HBT y el test de tolerancia a la lactosa (TTL) en función del H 2 B. Métodos Se estudiaron 430 pacientes (40 años, Q1–Q3 = 28–54 años; 66,7% mujeres) con sospecha de malabsorción de lactosa. Se recogieron basalmente y secuencialmente tras la administración de lactosa, muestras de aliento para medir el hidrógeno espirado y de sangre heparinizada para medir la glucemia. Resultados El 69,5% de los pacientes tenían H 2 B <10 ppm, el 14,7% valores entre 10 y 20 ppm, y el 15,8% >20 ppm. En los pacientes con H 2 B <20 ppm la concordancia entre el HBT y el TTL era moderada, mejorando siempre al emplear un punto de corte de 15 mg/dL en el TTL. El incremento de hidrógeno y el de glucosa correlacionaron negativamente (r=−0,389; p<0,05). El aumento observado en la glucemia durante el TTL no variaba en función de los niveles de H 2 B registrados en el HBT. Conclusiónes El TTL puede ser una alternativa al HBT para evaluar la malabsorción de lactosa cuando los niveles de H 2 B sean elevados o las circunstancias desaconsejen el manejo de muestras de aliento. La mejor concordancia se observa cuando se toma como punto de corte en el TTL de 15 mg/dL.

Objectives Clinical laboratories should use only validated procedures. Precision is an important factor in the validation and verification of a new measurement procedure. Our objective was to verify the precision and trueness of different analysers used for the biochemical and immunochemical characterization of analytes. Methods Advia 1800 ® , Immulite ® 2000 and CentaurXP ® analysers and the Atellica ® Solution system were used. Five analytes were characterized biochemically, whereas another five analytes were characterized immunochemically. Imprecision was assessed using BioRad ® and Siemens ® control materials. Within-run and between-run imprecision were calculated by analysing three replicates of each control in a single run every day for five days. Bias was assessed using 40 samples of serum by the analysis of differences and linear regression. Results The within-run and between-run imprecision values obtained with the new measurement procedure were lower than the ones claimed by the manufacturer for all the analytes studied. In the bias study, a proportional but not constant systematic error was observed in some analytes. Conclusions The coefficients of variation obtained with Atellica ® Solution verified both, the imprecision specifications claimed by the manufacturer and by the laboratory. The conditions of calibration should be revised for some parameters and a wider range of samples should be used.

Resumen Objetivos El laboratorio clínico debe usar solamente procedimientos de medida validados. La precisión es una de las características más importantes para seleccionar, incorporar, validar y verificar un procedimiento de medida. El objetivo fue verificar la precisión y veracidad de varias magnitudes en distintos analizadores de bioquímica e inmunoquímica. Materiales Los analizadores en uso fueron Advia 1800 ® , Immulite ® 2000 y CentaurXP ® , y el sistema evaluado fue Atellica ® Solution. Se evaluaron cinco magnitudes para bioquímica y cinco para inmunoquímica. Para estudiar la imprecisión se utilizaron materiales de control comercial de BioRad ® y Siemens ® , calculando la imprecisión intraserial e interserial analizando tres replicados de cada control en una única serie cada día, durante 5 días. Para el estudio de veracidad se analizaron 40 muestras de suero diferentes mediante el análisis de diferencias y regresión lineal. Resultados Los valores obtenidos para la imprecisión intraserial e interserial fueron menores a los proporcionados por el fabricante en todas las magnitudes estudiadas. En el estudio de veracidad, existe error sistemático proporcional pero no constante para algunas magnitudes. Conclusiones Según los coeficientes de variación (CV%) obtenidos en el Atellica ® Solution se verificaron las especificaciones de imprecisión proporcionadas por el fabricante y las establecidas por el laboratorio. Respecto al estudio de veracidad sería necesario para algunos parámetros, revisar las condiciones de calibración y ampliar el rango de muestras estudiado.

Objectives Describe a case with axonal Charcot-Marie-Tooth (CMT) type 2W, a neurological disease characterized by peripheral neuropathy typically involving the lower limbs and causing gait alterations and distal sensory-motor impairment. Case presentation We report this case, where the application of massive genetic sequencing (NGS) with clinical exome in a molecular genetics laboratory enabled to detect the presence of candidate variants of the clinic of the patient. Conclusions The variant detected in HARS gene suggests that this variant could be causative of the symptoms of the patient, who went undiagnosed for 20 years and experienced an exacerbation of symptoms over time.

Resumen Objetivos Describimos un caso con enfermedad de Charcot Marie Tooth axonal tipo 2W, trastorno neurólogico caracterizado por una neuropatía periférica, que afecta principalmente a las extremidades inferiores y provoca dificultades en la marcha y deterioro sensitivo-motor distal. Presentación del caso Es un caso en el que la aplicación de las nuevas técnicas de secuenciación masiva (NGS) a través del exoma clínico en los laboratorios de genética permitió detectar la presencia de variantes candidatas de la clínica del paciente. Conclusiones La variante detectada en el gen HARS podría apoyar la causalidad en el contexto clínico del paciente tras 20 años sin diagnóstico y con empeoramiento de la clínica.