Exom-Sequenzierung zur Identifizierung von Krankheitsgenen
-
K. Neveling
Zusammenfassung
Neueste Sequenziertechnologien („next-generation sequencing“) erlauben die gleichzeitige Sequenzierung aller proteinkodierender Sequenzen, das sog. Exom. Die Identifizierung der jeweiligen pathogenen Mutation unter den Tausenden detektierten Varianten stellt dabei eine große Herausforderung dar, und neue Strategien für die Priorisierung von Varianten sind unerlässlich. Die jeweilige Wahl einer Strategie ist dabei von verschiedenen Faktoren abhängig, wie z. B. dem Vorhandensein gut charakterisierter Patienten und deren Familien, von der Art der Vererbung, der Schwere der Krankheit sowie deren Frequenz in der allgemeinen Bevölkerung. In dem vorliegenden Übersichtsartikel diskutieren wir die heute gebräuchlichen Strategien zur Identifizierung von neuen Krankheitsgenen mittels Exom-Sequenzierung und beschreiben die Lehren der ersten Exom-Studien. Wir glauben, dass die Sequenzierung von Exomen in den folgenden Jahren die am häufigsten angewandte Methode zur Identifizierung von Krankheitsgenen sein wird und dabei gleichzeitig auch ein großes diagnostisches Potenzial aufweist.
Abstract
Next generation sequencing can be used to search for Mendelian disease genes in an unbiased manner by sequencing the entire protein-coding sequence, known as the exome. Identifying the pathogenic mutation amongst thousands of genomic variants is a major challenge, and novel variant prioritization strategies are required. The choice of these strategies depends on the availability of well-phenotyped patients and family members, the mode of inheritance, the severity of the disease and its population frequency. In this review we discuss the current strategies for Mendelian disease gene identification by exome resequencing, and we describe the lessons learned from the first exome sequencing studies. Exome sequencing is likely to become the most commonly used tool for Mendelian disease gene identification for the coming years and bears a great diagnostic potential as well.
© Springer-Verlag 2012
Artikel in diesem Heft
- Exom-Sequenzierung zur Identifizierung von Krankheitsgenen
- Spalthand-/Spaltfußfehlbildungen
- Fibrodysplasia ossificans progressiva
- Mosaiktrisomie 8p11.21q11.21 als Prädisposition für myeloische Leukämien
- Netzwerk Hypophysen- und Nebennierenerkrankungen e.V.
- Das 2q37-Deletionssyndrom
- Aktuelle Nachrichten
- Mitteilungen der GfH, 1/2012
- Ein Porträt von Prof. Dr. Dr. h. c. Wolfgang Engel
- Mitteilungen des BVDH, Heft 1/2012
- Mitteilungen Aklademie Humangenetik Kalender
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